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核心多糖,又称核心区,位于脂质A 的外层,由2-酮基-3-脱氧辛酸(2-keto-3-deoxyoctonate,KDO),庚糖、磷酸乙醇胺及己糖(葡萄糖、半乳糖等)所组成,其外端以糖苷键与O抗原链相接(图1-4)。在一般革兰阴性杆菌脂多糖的核心多糖中,KDO和庚糖是其特定的成分。核心多糖近端的庚糖通过三个KDO与脂质A以共价键相连,该结合键易被弱酸所破坏。在LPS结构中核心多糖主要起着连接多糖与脂质A 的作用。核心多糖有属(genus)特异性,同一属细菌的核心多糖相同,相对О特异性抗原而言核心多糖的变异性极小,呈高度保守状态。
KDO和庚糖是一般革兰阴性杆菌的特定成分,但黄单胞杆菌(Xanthamonas)和铜绿假单胞菌(Pseudamonasaeruginosa)却缺少庚糖。厌氧的梭形杆菌(Fusobatericum)具有与沙门菌相似的化学成分,而厌氧的类杆菌,如黑色素类杆菌(Bacillu s m elan inog en icu s)和脆弱类杆菌(Bacillu s f rag ilis)则缺少KDO和庚糖。霍乱弧菌亦缺少KDO。