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O抗原多聚体一旦与脂质A核心连接,就停止多聚化反应。也就是通常所说的连接反应能够终止多聚化反应。脂质A核心及已结合不同长度重复单位的脂多糖都能有效地转移到外膜上,因此用SDS-PAGE能看到脂多糖分子大小不一,这是由于生物合成系统的差异而不是输出系统的因素所致。
不同细菌的O抗原侧链分布不同,有的含约20个重复单位的多聚体占据优势,有的可能为约100个重复单位的多聚体占据优势,在SDS-PAGE电泳中由于不同种属的细菌其不同分子的银染色着色强度差异得到体现。不同细菌的O抗原侧链长度分布不同的原因,可能在O抗原的多聚化或连接反应过程中有一个大小选择因子在起作用。在以Wzy依赖型途径合成抗原的细菌中,Wzz(即Rol或Cld)是调节侧链长度分布的重要蛋白质,但其具体作用机制目前还不清楚。